(一)核心层
集群式供应链的供应商、制造商、批发商、零售商和终端客户等组织，依据供需关系，形成基于本地一体化的供应链：同时，供应链上的节点企业根据市场需求、技术能力不同，进行跨链间的有选择性的连接，在集群中形成敏捷性的供应链网络。而每条供应链以核心企业为主体，将上游和下游的企业紧密联系起来，以信任为基础密切合作，不断提高整条供应链的运作效率。
产业集群内是否能清楚地找到企业间的供应链联系， 关键是看集群内是否存在一批实力较强的供应链核心企业供应链上的企业虽然彼此独立，但其结构并不是松散无序的。由于核心企业在链上的“组织”功能，所以其有能力吸引并“控制”上下游配套企业进入供应链，非核心企业也有动力自觉地进行调整以适应核心企业的需求，两者密切协作成为战略合作伙伴，进而保证了供应链的一体化运作。
根据核心企业之间实力、规模、品牌、技术等方面的差异。将围绕其形成的供应链分为三类。第一类：核心企业在研发、品牌、关键零部件生产上具备一定的竞争优势，能够对上下游企业进行资源整合配置，与之相配套的上下游企业也具有一定的实力。易于实现整个供应链的协同运作。第二类：以一些中小型企业为代表，具备一定的规模和经济实力，但在品牌和技术方面相对薄弱，与之相配套的上下游企业也较弱些。第三类：主要是一些小型的生产加工组装企业，它们一般规模小、范围窄，技术能力缺乏。
以核心企业为主导形成多条供应单链，供应单链内部及单链之间的相互关系， 构成了集群式供应链的核心部分。
(二)辅助层
集群式供应链的外围还存在许多辅助性机构。如地方政府、科研机构、金融机构和中介机构等，它们构成了集群式供应链的辅助层。虽然辅助层不是构成主体，但却是集群式供应链的重要支撑。地方政府制定相关优惠政策，完善集群公共设施，营造利于集群发展的外部环境，推动集群持续发展；大学和科研机构为产业集群提供先进技术，是其技术创新的源泉和持续发展的根本动力：金融机构建立健全融资体系和融资渠道，构建健康有序的金融环境，不断提高产业集群竞争力；中介机构为集群企业提供信息和培训服务的同时，还为政府和企业间架起桥梁和纽带。
