进出境阶段：
1、持减免税证明、许可证等相关证件按一般进出口货物办理报关程序。
2、注意：报关单上的备案号一栏的填写，不要填写错误
后续阶段：
海关监管的解除
1、监管期满，根据有关企业的申请，海关核准后解除监管。
2、监管期内解除海关监管（例如说，机器设备它的监管期是5年，还没满5年呢，要申请解除海关的监管，例如说为了在国内销售、或者转让给别的企业、或者是放弃这些设备，或者是将这些设备退运境外），我们就来看，不同的情况，手续是如何办理的。
（1）在海关监管器内销售、转让的，企业应向海关办理缴纳进口税费的手续。
（2）将货物转让给同样享受进口减免税优惠的企业，接受货物的企业应当先向主管海关申领“进出口货物征免税证明”，凭以办理货物的结转手续。
（3）退运出境的，向出境地海关办理货物出口退运申报手续。出境地海关监管货物出境后，签发出口报关单，企业持该报关单及其他有关单证向主管海关申领解除监管证明。
（4）要求放弃特定减免税货物的，向主管海关提交放弃货物的书面申请，经海关核准后，按规定来办理手续。海关将货物拍卖，所得款项上缴国库后签发收据，企业凭这这个收据想主管海关申领解除监管证明。
3、企业破产清算时，特定减免税货物的处理。
企业进入到破产清算程序时，对于还处在海关监管期内的特定减免税货物，企业，首先向主管海关申请，经主管海关同意，缴纳应纳税款，获得解除监管证明，然后才能够处理该货物。
