税收具有固定性、无偿性、强制性的特点。
绿色关税在具有上述一般特征以外，还具有以下两个独有特征：
1.社会与生态的统一性。传统的税收制度侧重于调节人与人、人与国家之间的关系，从税收征纳实体法律制度包括的商品税、所得税、财产税三个方面的法律制度名称中不难看出其体现的是其社会性，对于自然资源，只不过是把其作为人类财产权的对象来对待。而绿色关税则强调把环境保护与社会经济活动全面、有机地结合起来，按照可持续发展原则规范进出口活动，从而保护环境。可见绿色关税以生态化的理念重新调整了进出口秩序，体现了人与自然相和谐的生态性特征。
2.征收与支出的整体性。传统的税收制度下，税款作为国家的财政收入，在国家财产进行再次分配时，其遵循的是哪里需要则往哪儿划拔的原则。而绿色关税则遵循的是“专款专用”的原则，即可在法律中明文规定该绿色关税收入款项只能用于环境与资源保护方面，以确保环境与资源的保护和可持续发展。因为绿色关税征收的税款中不仅仅包含有我们当代人损耗的环境与资源所应缴纳的赔偿，而且还包含着我们损耗了后代人所应当拥有和使用的环境与资源的补偿。
