政府采购效益评价体系的科学性、实用性和可操作性是实现对政府采购效益客观、公正评价的前提。政府采购效益评价体系的设计应遵循“内容全面、方法科学、制度规范、操作简便”的基本原则。
首先，效益评价的内容要全面。要综合评价政府采购效益，必须将反映政府采购活动的各种因素纳入评价范围，并据此设计指标体系。
其次，效益评价的方法要科学。所谓科学的评价方法是指，评价方法要与评价内容和指标体系结构相适应，能够得出客观、真实的评价结果。政府采购效益评价的方法很多，我们可根据评价内容和指标体系特点，选用功效系数法和综合分析判断法作为政府采购效益评价体系的评价方法。
再次，要坚持客观公正的原则进行效益评价。运用政府采购效益评价体系对政府采购实施外部评价，如果不能做到客观公正，就会导致评价结论的使用者作
出错误的决策，无论是政府部门、采购商、供应商都不会信服。所以，我们在合理设计指标体系、科学选择评价方法的同时，要制定统一的评价标准，规范评价操作程序，从而保证评价结果的客观公正性。
最后，效益评价的操作要简便。无论多么完美的评价体系，如果操作过于复杂，就不可能被广泛使用，而且容易出现操作失误。所以，为了确保评价操作的准确性，提高工作效率，便于推广使用，我们要充分利用现代管理技术，设计评价操作软件，以提高评价效率。
