供应链契约经过这么多年的发展，已经趋于完善，但现阶段仍然存在一些问题，主要表现在两个问题上：
（1）多阶段、多供应商和多零售商的协调问题
现阶段对供应来请你月的研究大多还停留在单一供应商与单一零售商之间签订的契约。对于多个供应商负责多个不同的生产阶段面向多个不同的零售商的复杂问题还少有涉猎。
即使有部分学者对此进行了研究，但大多有较大的局限性，如未考虑处于同一层面的供应商之间的竞争可能带来的损失，或者这两个公司合作所带来的利益，依然存在极大的问题。
（2）供应链中的信息对称问题
现阶段为供应链契约研究所建立的模型大多基于理想化的信息对称假设，供应链成员共享他们所获得所有信息，但在实际生产中供应链成员会保有一些私有信息例如：市场信息等对供应链生产至关重要的信息，也因此对供应链生产效率产生了一定的不利影响。现阶段学者对这部分的研究并不是十分深入，虽有学者研究这些问题，但大多没有切入重点，真正解决这个问题，还只是分析这个问题会对整个供应链产生多大的影响。
