供应链管理作为一种新的管理库存模式在我国还处于探索阶段，而电子商务环境所要求的基础设施、技术条件、人文条件等也还很不成熟，在两者的结合上企业仍有很长一段路要走。笔者认为当务之急应处理和解决好以下几个问题：
1.企业观念问题。供应链管理对企业最基本的要求是核心业务和信息效率。这并不是仅仅依靠企业电子商务的实行就可以解决的，更重要的是企业从观念上进行根本改变。许多年来，我国企业为了更好地实施内部管理与控制，一直采用“纵向一体化”的管理模式。随着信息的飞速发展和经济全球化市场的形成，传统的管理模式受到了严重冲击。尽管企业也在努力地朝“横向一体化”的新型思维方式转变，但总体而言，大多数企业还未形成独具特色的强竞争力的核心业务，传统的管理思维方式仍占据主要地位。
2.管理信息化的技术要求问题。在供应链管理模式中，信息共享是企业间实现协调运作的关键，而应用信息技术改进整个供应链的信息精度、及时性和流动速度是提高供应链绩效的必要措施。因此，企业管理战略的一个重要内容就是制定供应链运作的信息支持平台，如集成条形码、数据库、电子订货系统、射频识别、电子数据交换、全球定位系统等信息交换技术和网络技术为一体，构建企业供应链信息集成系统。
3.贸易伙伴之间的协作问题。电子商务为供应链管理提供了一个可以更好发挥的环境，而我国企业欠缺的正是如何协调贸易伙伴间的协作以达到供应链整体利益的最大化。贸易伙伴之间不愿意共享信息，这与我国的企业所处的文化氛围有关。传统观点认为任何协议都会分出一个胜者和一个负者，但博弈论的研究结果说明非零和博弈比这种零和博弈更能使企业获得收益。除此之外，缺乏一个良好的供应链绩效评估系统也是贸易伙伴之间协作的障碍。没有合理的绩效分配，各企业自然不愿牺牲自己的利益去换取整个供应链的最大利益。因此，良好的供应链协调战略势在必行。
4.供应链中各环节成员的利益分配问题。随着电子商务的发展，组织之间的信息流和资金流更加频繁，组织之间的相互联系也由单一渠道转变为多渠道，合作程度日益加深，组织之间不断融合，组织边界越来越模糊，最终整个价值链重新整合，形成一个虚拟的大企业。由此产生了企业间的“利益分配问题”。
