集群网络式供应链系统作为一种新的组织形式，它具有三个特点：一是有向性，即包含了某一产业或某一产业中某类产品从上游企业的原始投入到下游企业最终产出的产业链或产品链，表现为一种整体流向的方向性，而不是一种无规则的发敞行为，这体现出集群的单元企业在生产中的是以产业关联集合在一起；二是网络结构性，集群每个单元企业的高度专业化分工使每个单元企业在集群与周围企业形成横向联系和纵向联系，呈现一张纵横交叉的协作网络，这是与传统线状式供应链系统最本质的区别之一，在这种网络中不仅存在多个传统式线状供应链系统，而且这些供应链系统中的每个单元企业是相互联系的；三是核心性，集群存在和发展的基础是特定地域存在着某产品或产业，在R&D、制造加工或市场信息等方面具有无可比拟的优势，能使某产品或产业根植于某地域，不断吸引相关的企业的加盟聚集，使集群能不断地具有自我扩展、自我创新的功能，这种向心力的作用来源于具有上述优势的核心企业，而核心企业构成网络组织横向基础，相关中小企业对网络组织形成纵向补充。传统企业之间是通过市场交易来联系，单个企业所能利用的资源有限，仅限于该企业的内部，而集群网络式供应链系统使各个独立的企业组成了一个动态的纵横交错企业网络，在这个网络中，企业利用市场交易实现资源配置的同日寸，还可以通过与合作企业的非正式合约来利用网络组织其他企业的资源。这样集群网络式供应链的企业扩大了单个企业可利用的资源范围，在通过非正式合约摆脱市场机制协调，降低交易成本的同时随之也产生一些问题。
a.协调的界面有效性。 被“网”入集群网络式供应链系统的单个企业来说，管理网络的能力有大有小，有的起到主导作用，有的则处于从属地位，这种企业对网络的管理能力就表现为企业协调能力，由于单个或多个企业自身力量的限制，网络管理能力很难遍历整个集 网络供应链系统，就形成协调界面的有效性。企业的协调能力一方面除了取决于自身的竞争能力的大小和对组织间的管理能力，另外还取决于协调不同企业必然会产生相应的费用，其费用成本能否维持在一个合理的水平上。协谪界面的有效性还受到区域内集中较多的对等或不等同的核心企业所提供的机会主义，以及网络供应链链长和链宽的制约。
b.风险的分担。市场风险的不确定性必然影响网络企业间的协调，集 网络式供应链是介于市场和企业的一种新的网络组织，虽然这种精巧的组织有着较好的敏捷反应能力和对规避市场风险能力的更强适应性，但这并不等同网络组织协调风险分配能力的增强，恰恰相反，在这种非法人的网络结构组织中，为了追求系统的最优，必然造成网络系统协调和单个企业自身协调的冲突，所以分担和补偿风险损失也是网络组织在协调中的难题。
c.机会主义的存在。集群网络式供应链系统中的机会主义的存在，归结于企业经济行为人在一定认识能力和客观条件，对有限的可能行为进行理性选择的结果，如果这种结果能顺利完成而不受到任何惩罚，并且没有其他合适途径获利，人们就会选择机会主义，机会主义的倾向将弱化协调机制发挥作用，在集群网络组织中，不管是生存空间的恶劣还是盈利空间的巨大，在私利的驱动下企业都会被诱发出机会主义的可能。
d.敏捷性的损失。集群网络式供应链系统既具有网络特征，又有供应链系统的特点。那么供应链系统存在的“牛鞭效应”也在其中发生作用，究其原因是由于链上各企业、各组织之间缺乏有效信息沟通与集成而形成的后果。比如当市场对某种产品的需求发生变化，与市场终端相靠近的环节企业反应快、损失小、风险低；而在横向远离市场上游的环节的企业则因。牛鞭效应放大滞后效果，反应慢、库存大而风险高。同时反应的滞后性也向纵向转移。但纵向企业大多为容易转产的中小企业，而横向链上企业间滞后反应是在集群网络式供应链表现尤为显著，所以协调的好坏势必对企业敏捷性产生影响。
