运输服务的一般作业流程包括接单、发运、到站和签收四个环节，另外还有在发运和到站中可能存在的短驳和中转。
1．物流运输服务的接单管理
接单管理中，要了解客户的来源以及真正的需求，为争取主动创造有利的条件。应根据订单利润空间的大小，确定是否接受订单，如接单则需合理配置资源，并优先满足关键客户，并不断超越他们的期望，以获得更大的利润空间。物流服务中一项重要服务内容就是提供配送、拆装等增值业务，为了保证在进行货物运送时不丢失、不混乱，就必须弄清楚货物的详细信息。因此，在接单环节，除了一般的货运信息外，还应提供货物明细信息的维护功能。
2．物流运输服务的发运管理
发运业务是指按照交通运输部门规定，根据运输计划安排，通过一定的运输方式和运输工具，把货物从生产地(或起运地)运到销地(或收货地)的第一道环节，是运输业务的开始。
由于这项工作是整个运输工作的第一道业务环节，因此，对整个运输过程中的时间、运量、质量、费用及安全性等运输经济指标起着决定作用，是保证第三方物流运输服务质量的基础。
由于各类货物需要的运输方式不同，其流转手续、操作也有所不同，一般来说，发运作业可分为以下工作流程。
1)货物的组配
货物的组配就是根据货源、运力的情况，将待运的各种货物按照性质、重量、体积、包装、形状、运价等因素合理地配装在一定容器的运输工具里。组配是一项技术性很高的工作，直接关系到运输工具的利用程度、运费的高低和货物的安全。组配是发运业务的第一道环节，直接影响运输的质量。
2)制单
制单主要是商品运单和运输交接单。商品运单是办理托运和承运手续的依据，也是物流企业安排运力、办理商品交接和计费的原始凭证，它一经签订便具有契约性质。运输交接单是企业与接运方或中转方之问商品交接的凭证，也是收货方掌握在途商品情况及承付货款的依据。
3)办理托运手续
交由其他运输企业运输的商品，要根据制好的单据办理托运手续，其受理后，即可根据指定的时问和货位送货，办理交接手续。送货时，必须保证商品包装完整，标志清楚，以防止错串。
4)送单
领货凭证、付费收据、运输交接单、商品调拨供应单、补运单、商品供应凭证等随货物同行的单据，应在办完托运手续后及时发给接收方，以便其收货时清点验收。例如铁路整车发运一般采取单货同行的方式，而水运由于其速度较慢所以多采用邮寄方式。
5)通知
商品发运后应立即向收货方通报发站、到站、发运车号、运单号、件数、重量、发运日期等情况，以便收货方及时作好接收商品准备工作，或中转方充分做好接转商品的衔接工作。
6)结算
在商品发运后，根据不同的发运方式，发货方向收货方或承运方核算和收付代垫运杂费和其他费用。
3．物流运输服务的接运管理
货物接运是指货物从发运地到达收货地后，收货单位根据到达的站、港通知，同物流企业办理的货物点验接收工作。接运关系到运输时间、货物质量和能否及时入库和销售，直接关系到运输服务的质量和在运输过程中的责任分担，从而对客户接受的运输服务的满意度产生直接的影响。
4．物流运输服务的中转管理
商品中转运输，是指商品在从发地到收地的运输过程中，由于受购销数量、自然地理位置和交通线路等影响不能直达，必须经两种(项)或两种(项)以上的运输工具换装，才能运达目的地的运输业务。由于中转运输连接着收货方和发货方，在运输过程中起着承先启后的作用，所以，中转的好坏直接影响着商品运送时间的长短、费用的高低、商品的安全和运输的经济效益。
