物流信息系统建设是一项艰巨复杂的系统工程，牵涉到企业经营管理的方方面面，绝非是物流软硬件的简单“整合”。管理水平的高低直接决定物流信息系统功能的发挥。物流信息系统只是企业内部一个技术概念，其核心构件应该是物流的流程模型。因此，物流信息系统的建设必须以管理思想创新为基础，物流管理思想创新主要表现在以下几个方面。
(1)物流管理核心化
物流管理核心化，是指建立以数据获取、分析为中心的物流信息系统，从庞大的数据集中挖掘潜在的信息价值，洞察优势机会，从而实现企业的增值。
(2)物流管理一体化
物流管理一体化将实现以物流系统为核心的由生产企业经物流企业、销售企业，直至消费者的供应链的整体化和系统化。物流管理将面向全球客户，建立起全球供应链售后服务体系、需求信息网络、合作关系网，等等。
(3)物流管理技术化
物流企业内部、物流企业之间以及物流企业与上、下游企业之间的信息交换以及物流实体配送等，都需要电子数据交换、自动仓储管理、条形码、多媒体、自动分拣以及存取跟踪等技术的强有力支持。
(4)物流管理柔性化
电子商务的发展，使客户需求不断发生变化，为满足客户小批量、个性化、快速化的柔性需求，物流管理也需要由刚性化过渡到柔性化。
