物流系统的目的一般不止一个，即使同一层次的目的也往往有多个。例如，城市物流系统既要能改善公共交通环境，又要能缩短车辆行驶时间，方便商品流动和人员流动。在资源既定的情况下，如果决策者力争达到某个目的，那么，其他日的则无法在最大程度上达到，甚至彼此冲突。就足说，对于两个以上的目的，除非一个目的隶属于另一个目的，否则这些目的之间总是彼此矛盾的。物流系统中，这种多目的之间彼此矛盾的现象普遍存在，进行系统目的分析时，必须采取适当的处理方法，对各日的的重要性进行排序，在不损害第一项日的的前提下完成第二项目的，或将其他目的作为约束条件处理。
进行物流系统目的的分析时，必须保证系统目的符合下面几项原则：
1．技术上的先进性；
2．经济上的合理性和有效性；
3．同其他系统的兼容性和协调性；
4．对外部环境变化的适应性。
物流系统目的分析的主要内容包括：对系统目的的必要性分析、可行性分析、完整性分析及层次性分析。
