1．农产品物流外包模式
农产品物流外包模式是第三方物流企业独立承包一家或多家农产品生产企业或经销企业的部分或全部物流业务。对农户、农产品生产企业或经销企业而言，物流外包不仅有利于降低库存、节约物流成本，而且，物流外包后，农户、农产品生产企业或经销企业能够集中有限的资金、设备于核心业务，从而进一步提高企业竞争力。对第三方物流企业而言，以契约形式承接物流外包业务，一是有利于与客户形成长期的合作关系，保证业务量；二是可以避免物流设备的闲置。
目前，我国大多数农产品物流业务就是这种模式。严格地说，这种模式与传统的运输，仓储业并没有太大区别。因为这种模式主要是以生产商或经销商为中心，农产品生产企业、经销企业与第三方物流企业之间缺少沟通的信息平台，容易造成生产的盲目，运力的浪费或不足，或者是农产品库存结构的不合理。
2．第三方农产品物流联盟模式
农产品第三方物流联盟模式是指第三方物流企业包括运输、仓储、信息经营者等以契约形式结成战略联盟，实行联盟成员间的协作与信息共享，形成第三方物流网络系统，实现农产品物流的规模化和网络化。联盟成员包括多家同地地和异地的各类运输企业、场站、仓储企业及农产品信息经营商。目前，我国的一些地方性农产品电子商务网站一般是采用这种模式。
相比于物流外包模式，这种模式有两方面改善：一是创建了物流联盟信息共享平台，实现了联盟成员间的信息共享和信息交流，有利于联盟内部成员企业物流资源的优化配置。二是联盟实体企业之间行分工协作，某些票据可以在联盟内部通用，有利于减少中间手续、提高效率，使得供应链衔接更顺畅。例如，联盟内部经营各种方式的运输企业进行合作，实行多式联运，可以大大节约运输成本。但由于联盟成员实行独立核算，在彼此利益不一致的情况下，彼此之间更大范围的资源优化受到一定的限制。
3．农产品综合物流模式
一般来说，综合物流模式的运作要求组建综合物流公司或集团，综合物流公司集成物流的多种功能——仓储、运输、配送、信息处理及其他一些物流辅助功能服务，不仅可以为上游从事农产品生产的农户或企业提供原材料供应、产品代理及物流管理服务，而且也可以为下游经销商代理农产品配送、代收货款等业务，同时完成商流、信息流、资金流、物流的传递。综合物流模式的管理思路是充分利用社会上现有的物流设施、设备人才，运用第三方物流企业自己成熟的物流管理经验，提供多样化的为客户量身订制的物流服务。
随着我国物流业的调整振兴、农产品贸易量的不断扩大，农产品生产者和消费者对农产品物流服务的需求将会急剧增加，自营物流将越来越难以满足居民多样化、差异化的需要。而且，随着物流国际化的发展，国内物流业会面临越来越激烈的竞争，必将迫使国内传统物流企业向第三方物流快速转变。因此，在物流全球化和国际金融危机的背景下，我国应加快传统储运企业、粮食购销企业的改造，大力培育和支持第三方农产品物流企业的发展，以谋求我国第三方农产品物流业更大的发展空间。
