(一)承运人与托运人之间可能产生的风险
1．货物灭损带来的赔偿风险
对货物的灭失和损害，一般发生在运输、装卸和存储等环节。发生的原因可能有客观因素，也可能有主观因素。客观因素主要有不可抗力、火灾、地震等，主观因素主要有装卸工艺设计不当、运输方案设计缺陷等。
2．延时送达带来的责任风险
在物流合同要求下，物流企业延时送达往往导致客户索赔。在实践中，客户索赔的依据大多是物流服务协议，也就是说，此时物流企业承担的是违约赔偿责任。
(二)承运人与分包商之间存在的风险
1．风险的传递
风险传递是指工程物流企业能否通过分包协议把全部风险有效传递给分包商的风险。例如，某物流企业与客户签订的协议规定赔偿责任限额为每件500元，但工程物流企业与分包商签订的协议规定赔偿责任限额为每件100元，差额部分则由工程物流企业承担。一旦发生问题，尽管工程物流企业对分包环节造成的货损并没有过错，但依据合同不得不承担差额部分的赔偿责任。由于目前我国铁路、民航、邮政等部门对赔偿责任标准限额普遍规定较低，因此工程物流企业将面临着不能有效传递和分摊风险的风险。
2．信息交流不畅的风险
由于工程物流的特殊性，使得对货物运输的要求较高，在分包的过程中承运人和分包商之间的信息交流不畅容易造成操作不当等问题，这时承运人就需要承担其风险。
(三)与社会公众之间可能产生的风险
1．环境污染风险
工程物流活动中的环境污染主要表现为交通拥堵、机动车排放尾气、噪声等。根据环境保护法，污染者需要对社会公众承担相应的法律责任。
2．交通肇事风险
运输司机在运输货物的过程中发生交通肇事，属于履行职务的行为，其民事责任应该由其所属的物流企业承担。
3．危险品泄漏风险
危险品在物流作业时有泄漏的风险，随时会给社会公众的生命财产安全带来威胁。
4．其他
应重点考虑因工程物流项目导致沿途的拆迁、占用耕地等现象。
