物流费用控制是指运用成本会计的方法，预定费用限额，将实际物流费用与限额做比较，纠正不利的差异，提高经济效益。从总体来说，物流费用的控制由局部控制和综合控制组成。
（一）物流费用的局部控制
物流费用的局部控制是在物流活动中，针对物流的一个或某些局部环节的支出所采取的策略和控制，以达到预期的物流成本目标。物流费用的局部控制包括：运输费用控制、装卸搬运费用的控制、储存费用的控制、包装费用的控制、流通加工费用的控制等。
局部控制的不同控制方式的选择依赖于企业物流的运营模式。企业管理必须协调各个部门，在符合经济原则和因地制宜原则的前提下努力实现企业物流过程的综合控制。
（二）物流费用的综合控制
包括事前、事中、事后对物流费用进行预测、计划、分析、反馈、决策等全过程的系统控制，以达到预期目标。综合控制有别于局部控制，具有系统性、综合性、战略性的特点，有较高的控制效率。综合控制的目标是局部控制的集成，促使企业物流费用趋向最小化。
（三）物流费用的局部控制和物流费用的综合控制二者的关系
在物流费用控制中，存在不可控因素的限制，使物流费用综合控制可能并不完全覆盖物流的整个过程。许多企业的各个环节的物流费用降低仍有潜力可挖，因而，物流费用的局部控制的研究具有首要现实的意义。同时，又由于存在物流费用控制的“二律背反”，如：存储与运输两个环节都追求费用最小化，为降低储存费用，可通过在储存环节减少仓库数量，但由此却往往会引起运输环节费用的增长。这种“二律背反”的情况在物流系统的各个环节存在很多，所以如果不把所有相关费用用“总费用”的观点来衡量损益，就可能得不出正确的评价。因此，要求企业物流管理者从全局的角度，用物流系统的理论考虑各物流费用的综合控制，而不可仅满总于局部费用的降低，这是现代企业物流费用管理的要求。
