1、物流体系建设不合理，基础设施建设不完善
跨境电子商务需要更先进和完备的物流设施，因为它涉 及到跨国境的仓储、计税、运输等，为了使运输过程损耗更 小，速度更快，成本更低，都需要建设一个合理高效的物流 体系。而依赖于国际小包和国际快递的（运输时间长、成本 高）跨境物流冲抵了电子商务的快捷和便利，严重的制约了 跨境电子商务的发展。良好的跨境电子商务物流体系和基础 设施亟待建立。
2、物流信息化程度较低，综合水平不强
信息化是我国发展电子商务物流产业的重要基础，信息的 整合贯穿于物流企业特别是第三方物流企业经营的所有阶段， 物流信息资源的整合能力成为其核心竞争力的重要组成部分。 与西方国家相比，我国的第三方物流企业的信息处理能力水平 仍然较低，导致物流运行效率低下和客户服务水平低，制约了 其对外业务的发展。据调查，在我国物流服务企业中，绝大多 数物流服务企业尚不具备运用现代信息技术处理物流信息的能 力，如快递企业分发中心大多依靠人工分拣。在跨境电子商务 中，信息流不畅通及物流技术的落后会直接影响到跨境电子商 务的发展。
