风险的识别和评价是风险分析的两个过程。当前应用的风险分析方法有很多种，它主要包括Monte Carlo仿真、失效树分析、事件树分析 、失效模式、基于可信性的风险分析、文档分析和模糊分析法等，这些方法依赖有效的信息和要求不同的细节水平对风险进行定量或定性的评价。在电子商务交易风险风险分析中，研究者多是采用模糊分析法对交易过程的风险进行估计和评价。
Monte Carlo仿真根据不确定事件的要求建立概本模型，对各种风险变量(不确定因家)进行风险辨识，按照各风险变量的概率分布产生伪随机致，使用选定的序列随机数对模型中不确定的量进行限定，然后进行计算，并对结果进行统计分析；计算各指标的风险度。
失效树分析(Fault Tree Analysis, FTA)作为一种复杂系统进行风险预测的方法。在产品设计阶段，失效树分析可帮助判明潜在危险的模式和灾难性危险因素，发现系统的薄弱环节。
事件树分析(Event Tree Analysis, ETA)是风险分析的一种重要方法。它是在给定系统起始事件的情况下，分析此事件可能导致的各种事件的一系列结果，从而定性与定量的评价系统的特性。
失效模式、后果与严重度分析(Failure Modes and Effects Analysis, FMEA)在风险分析中占重要位置，是一种非常有用的方法，主要用于预防失效。它如果与失效后果严重程度分析联合起来(Failure Modes, Effects and Criticality Analysis, FMECA)，应用范围更为广泛。FMEA是一种归纳法。对于一个系统内部每个部件的每一种可能的失效模式或不正常运行模式都要进行详细分析，并推断它对于整个系统的影响、可能产生的后果以及如何才能避免或减少损失。基于可信性的风险分析是按照两类危险进行分析的:(1)系统运行过程中，预计进度计划受到干扰，预计的资金被突破或没有到位，可信性达不到预期水平。(2)系统或装置运行时发生失效，其后果可能导致人身伤亡建筑物破坏环境污染造成经济损失。风险分析按照这两类危险可能发生的概率大小和发生后造成的后果来度量。
模糊分析法(the fuzzy analysis)，将风险分析中的模糊语言变量用隶属度函数量化。由于在电子商务风险评价指标体系中存在着许多难于精确描述的指标，可以采用模糊综合评价法进行综合评价。具体是确定电子商务企业风险模糊综合评价指标集，给出电子商务企业风险综合评价的等级集，确定评价指标体系中各指标权重，模糊矩阵的统计确定，模糊综合评价，评出电子商务风险的最终综合价值。
